Onze favoriete beer uit Jellystone Park is weer terug en probeert nu ook in deze prachtige animatiefilm zijn lunch mand voor mand binnen te halen.
Dit tot groot ongenoegen van Park Ranger Smith. Yogi wordt altijd bijgestaan door de jonge beer Boo-Boo.
Wanneer Yogi erachter komt dat de gierige Mayor Brown het Yellystone Park voor eens en altijd wil sluiten, moet hij een team vormen met Boo-Boo én oude vijand Ranger Smith om dit tegen te gaan, anders zullen families nooit meer kunnen genieten van de natuur en raken Yogi en Boo-Boo hun "thuis" kwijt.
Tijdens het avontuur maken ze verder nog kennis met Rachel, een natuurdocumentaire-maker, die Yogi en Boo-Boo probeert te lijmen voor haar volgende film.