Franklyn toont een visueel verbluffende fantasie waarin het hedendaagse Londen en de futuristische metropool Meanwhile City samenkomen.
Preest, de gemaskerde held van Meanwhile City; Emilia, de mooie kunststudente wier projecten steeds dodelijker worden; Esser, op zoek naar zijn dakloze zoon in de straten van Londen en Milo, een dertiger met liefdesverdriet naarstig op zoek naar geluk.
Terwijl hun parallelle werelden met elkaar botsen, bepaalt één enkele kogel het lot van al deze personages.