Julia Roberts is Mary Reilly, een onschuldige huishoudster, die haar baas Dr. Jekyll adoreert.
Hij is een somber type die dag en nacht doorbrengt in zijn laboratorium, waar hij aan een experiment werkt. Middels dit experiment wil hij zich van zijn sombere kant ontdoen.
Alles pakt echter verkeerd uit: Dr. Jekyll´s persoonlijkheid wordt letterlijk gespleten en de man die hij kort daarna als zijn assistent aankondigt, Mr. Hyde, is alles wat Dr. Jekyll niet is.
Langzaam aan begint Mary het afschuwelijke geheim achter deze twee mannen te ontrafelen.