The Libertine brengt het verhaal van de tweede Earl van Rochester (Johnny Depp), vriend en beschermeling van Koning Charles II van Engeland (John Malkovich).
In de 17de eeuw leidde hij een leven dat volledig was gewijd aan het nastreven van persoonlijk genot en waarheid. Hij had een afkeer van hypocrisie die in die periode hoogtij vierde.
Hierdoor werd hij enerzijds aanbeden omwille van zijn Libertijnse aanpak, maar evenzeer gehaat door de een groot deel van de elite.
Op een dag ontmoet hij de jonge actrice Elizabeth Barry (Samantha Morton). Deze ontmoeting zal een grote invloed hebben op zijn leven...