De drie ninja-broertjes Rocky, Colt en Tum Tum gaan met vakantie naar hun favoriete pretpark Mega Mountain, waar ze hun grote ninja-held, Dave Dragon (Hulk Hogan) zullen ontmoeten.
Terwijl de drie lol aan het maken zijn, neemt de slechte Lothar (Jim Varney) de macht in het park over. In opdracht van zijn kinderhatende baas, Medusa (Loni Anderson), eist Lothar 10 miljoen dollar van de pretparkdirecteur.
Als de drie ninjaŽs op zoek gaan naar Dave Dragon, zien ze dat hij gevangen is genomen door de gemene Medusa.
De broertjes moeten al hun vechttechnieken aanwenden om tegen Medusa en zijn bende te strijden.
Het is een gevecht tot het bittere einde om hun held en alle onschuldige mensen in het park te redden.