John Travolta (Phenomenon en Pulp Fiction) speelt de detective Sean Archer die, koste wat kost, de psychotische terrorist Castor Troy (Nicolas Cage - The Rock en Con Air) wil pakken.
Castor, verantwoordelijk voor de dood van Seanīs zoon, wordt gearresteerd maar raakt in coma. Hij heeft Sean echter nog net verteld dat er in Los Angeles een biologische bom verborgen ligt.
Teneinde op het spoor van de bom te kunnen komen, wordt Sean door regeringsfunctionarissen gevraagd zich uit te geven als Castor.
Door middel van een medische ingreep worden de gezichten van Sean en Castor verwisseld. Sean neemt Castorīs leven over, maar intussen ontwaakt deze uit zijn coma, ontsnapt uit het ziekenhuis en neemt Seanīs identiteit aan.
Castor Troy maakt de bom onschadelijk en wordt een publieke held.
De échte Sean moet Castor zien te pakken om zijn leven terug te krijgen.