De film speelt af in de Sengoku periode. Achtenveertig machtige majins ontdekken de geboorte van een krachtige mens.
Ze geloven dat deze in de toekomst een krachtige demonenvernietiger zal worden.
Ze gaan naar de vader van het nog ongeboren kindje en vragen hem achtenveertig lichaamsdelen van het kindje te verwijderen.
Hij doet dit, nadat hem onverslaanbaarheid is beloofd.
Het kindje wordt meegenomen door Jukai, die hem opvoedt als een normale jongen.
Zonder ogen, mond en oren kan hij nog zien, praten en horen.
Toch wil hij wraak op de achtenveertig majins als hij volwassen is.
Hij wordt bijgestaan door Dororo, de grootste dief uit Japan.