The Witch speelt zich af in een geïsoleerde omgeving in New England, omstreeks 1630.
William en Katherine leiden samen met hun vijf kinderen een toegewijd christelijk leven. Hun huis is gelegen aan de rand van een ondoordringbare wildernis. Wanneer hun pasgeboren zoon op mysterieuze wijze verdwijnt en de oogst ook nog eens mislukt, lopen de spanningen binnen het gezin zeer hoog op.
William ziet dat als een straf van God en hij raakt ervan overtuigd dat de duivel een pact met één van zijn kinderen heeft gesloten.