Jane en Lisbon besluiten om hun nieuwe relatie geheim te houden voor hun collega's terwijl ze de moord op een undercoveragent onderzoeken. De jonge, ambitieuze agent Michelle Vega voegt zich bij het team.<br>
Lisbon gaat naar de gevangenis voor een undercoveroperatie. Ze probeert een band met een gevangene te krijgen zodat ze haar kan overtuigen om haar criminele vriendje te verraden.<br>
Jane en Lisbon reizen af naar Beiroet, waar ze samenwerken met Erica Flynn. Erica helpt de FBI, omdat haar vriendje wellicht is te maken heeft met een terroristische organisatie.Het team onderzoekt een moord die verband houdt met de handel in valse diamanten. Ondertussen is Abbott bezorgd dat zijn begaande overtredingen in het verleden de baan van haar man in gevaar brengen.<br>
In de laatste aflevering van de serie, besluiten Lisbon en Jane om te trouwen, maar hun happy end wordt verstoord door een op wraak beluste moordenaar.