Zoals de meeste tieners van zijn leeftijd, probeert ook Peter (Andrew Garfield) erachter te komen wie hij is en hoe hij de persoon geworden is die hij vandaag de dag is.
In zijn zoektocht hiernaar, ontdekt hij tussen alle puzzelstukjes uit het verleden een geheim dat zijn vader voor hem verborgen hield; een geheim dat uiteindelijk zijn lot vormt als Spider-Man.

Dit is de eerste in een reeks van films die een andere kant van het Peter Parker verhaal vertelt.