De 16-jarige Hanna (Saoirse Ronan) is een unieke tiener. Ze heeft de kracht, de hersens en het uithoudingsvermogen van een soldaat.
Dat heeft ze van haar vader (Eric Bana), een voormalig CIA-agent, die haar in Finland heeft opgevoed en getraind heeft tot een perfecte huurmoordenaar.
Als ze door haar vader op een missie door heel Europa wordt gestuurd, vindt er een verandering in haar jonge bestaan plaats.
Wanneer ze achterna gezeten wordt door de agenten van een meedogenloze spion (Cate Blanchett) en haar ultieme doelwit nadert, wordt Hanna geconfronteerd met een aantal openbaringen...