De bewoners van Ember leven al generaties lang in de enige nog verlichte stad op aarde.
Na een lange periode zonder problemen staan de krachtige motoren, die Ember van licht voorzien, nu op het punt het te begeven.
De bewoners vrezen voor hun toekomst en durven ook de stad niet uit omdat niemand ooit is teruggekomen uit het donker dat Ember omringt.

Doon Harrow en Lina Mayfleet geven de hoop echter niet zo snel op.
Wanneer Lina een stoffig doosje met geheime en cryptische instructies vindt, beginnen zij en Doon meteen met het ontcijferen ervan.
De code vertelt hen verbazingwekkende dingen over de geschiedenis en toekomst van de stad, en over een nieuwe wereld waar de bewoners van Ember naartoe kunnen vluchten.
In een race tegen de klok moeten Doon en Lina alle obstakels zien te ontwijken en een vluchtplan in gang zetten naar een wereld waarvan niemand wist dat deze bestond... voordat de lichten voor altijd uitgaan.