Dankzij de stralen van het Donkere Kristal leven de Gelflings in een wereld van welvaart en vrede.
Wanneer het Kristal door een aardbeving barst, komt er een einde aan hun gelukkige leven.
De Skeksès, de aartsvijanden van de Gelflings, maken gebruik van deze situatie en proberen hun vijanden uit te schakelen.
Alleen Jen, de laatste Gelfling, kan zijn ras redden, maar hij is erg jong en weet niet wat voor kwaad hem allemaal te wachten staat...