Voor de buitenwereld is Ghost Dog een zonderling figuur die het nodige respect afdwingt. Hij woont in een zelfgemaakte hut op het dak van een leegstaand gebouw, samen met een zwerm vogels.
Al jaren voert hij zijn werk als huurmoordenaar uit en kan zich onopgemerkt door de nachtelijke stad verplaatsen.
De erecode van de Japanse Samurai is zijn leidraad in het duistere leven.
Wanneer hij in zijn eergevoel wordt aangetast door de nietsontziende leden van een maffiafamilie, rekent hij met ze af door geheel volgens de regels en tradities van de Samurai te handelen.