Bij een FBI inval, geleid door Jack Bender (Dean Cain), wordt de sekteleider Silas Jansen gearresteerd, maar vallen er tevens verscheidene onnodige doden. Dit resulteert in Bender zijn ontslag.
Een jaar later vliegt hij terug naar huis na een mislukte sollicitatie. Een groep militante Amerikaanse terroristen, onder leiding van Greg Gilliad (Anthony Michael Hall), kapen echter diezelfde vlucht, Flight 732, en worden alle passagiers gegijzeld.
Hun eis: de vrijlating van hun leider Silas Jansen